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Infodengue / AlertaDengue
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This page gathers technical and scientific products developed by the Infodengue/AlertaDengue team to support surveillance, analysis, and communication on arboviruses in Brazil. It organizes technical reports, tools, webinars, scientific publications, theses, and other materials associated with the monitoring of dengue, chikungunya, and Zika, as well as related environmental factors.
Technical reports
- Análise de situação epidemiológica da dengue em ano de El Niño
- Relatório IMDC 2025: Previsões para a temporada 2025-2026 de dengue
- Relatório IMDC 2024: Previsões para a temporada 2024-2025 de dengue
- Reflexões sobre o risco de arboviroses em 2024
- Pathfinder Infodengue: Mapeamento de processos orientado por dados para o desenvolvimento de soluções e capacidades em pesquisa. Fiocruz/TGHN LAC, 2025.
IMDC webinars
YouTube Channel-
Webinar for the official announcement of the results of the validation of the second IMDC
-
Webinar with the official results and predictions for the upcoming season
Scientific publications associated with Infodengue
The items below follow the consolidated selection from the document used to create this page.
2025
- The Role of Climate Change in the Expansion of Dengue. medRxiv, 2025.
- Spatiotemporal relationships between extreme weather events and arbovirus transmission across Brazil. medRxiv, 2025.
- A statistical model for forecasting probabilistic epidemic bands for dengue cases in Brazil. Infectious Disease Modelling, 2025.
- Unraveling regional variability in Dengue outbreaks in Brazil: leveraging the Moving Epidemics Method (MEM) and climate data to optimize vector control strategies. PLOS Neglected Tropical Diseases, 19(6), e0013175.
- Strengthening resilience to emerging vector-borne diseases in Europe: lessons learnt from countries facing endemic transmission. The Lancet Regional Health - Europe, 53.
- Leveraging probabilistic forecasts for dengue preparedness and control: The 2024 Dengue Forecasting Sprint in Brazil. Proceedings of the National Academy of Sciences, 123(7), e2508989123.
- Large-scale epidemiological modelling: scanning for mosquito-borne diseases spatio-temporal patterns in Brazil. Royal Society Open Science, 12(5), 241261.
- Assessing mosquito dynamics and dengue transmission in Foz do Iguaçu, Brazil through an enhanced temperature-dependent mathematical model. PLoS One, 20(9), e0330902.
- Introduction, establishment, and distribution of Aedes aegypti and dengue in a temperate capital of Brazil: a retrospective surveillance-based study. The Lancet Regional Health - Americas, 48:101153.
2024
- Harmonizing multisource data to inform vector-borne disease risk management strategies. Annual Review of Entomology, 70.
- Mosqlimate: a platform to providing automatable access to data and forecasting models for arbovirus disease. arXiv preprint, 2024.
- Dengue nowcasting in Brazil by combining official surveillance data and Google Trends information. medRxiv, 2024.
- A roadmap to account for reporting delays for public health situational awareness - a case study with COVID-19 and dengue in United States jurisdictions. medRxiv, 2024.
- Beyond the Metropolises: The Spread of Chikungunya in the Interior of Brazil. SSRN, 4872336.
- Beyond the metropolises: the decentralization of chikungunya to non-metropolitan areas across Brazil. Cadernos de Saúde Pública, 42(1):e00129025.
2023
- Joint spatial modeling of the risks of co-circulating mosquito-borne diseases in Ceará, Brazil. Spatial and Spatio-temporal Epidemiology, 47, 100616.
- A Platform for Data-Centric, Continuous Epidemiological Analyses (EpiGraphHub): Descriptive Analysis. Journal of Medical Internet Research, 25, e40554.
- Epidemic models and their use. Physics of Life Reviews, 45, 29-30.
- The expansion of chikungunya in Brazil. The Lancet Regional Health - Americas, 25.
2022
- Fast expansion of dengue in Brazil. The Lancet Regional Health - Americas.
- Faster indicators of chikungunya incidence using Google searches. PLOS Computational Biology.
- How heterogeneous is the dengue transmission profile in Brazil? A study in six Brazilian states. PLoS Neglected Tropical Diseases, 16(9), e0010746.
2021
- A framework for weather-driven dengue virus transmission dynamics in different Brazilian regions. International Journal of Environmental Research and Public Health.
- Probabilistic seasonal dengue forecasting in Vietnam: A modelling study using superensembles. PLOS Medicine.
- Modelling misreported data. In Building a Platform for Data-Driven Pandemic Prediction.
2020
- Large-scale multivariate forecasting models for Dengue - LSTM versus random forest regression. Spatial and Spatio-temporal Epidemiology.
- Emerging arboviruses in the urbanized amazon rainforest. BMJ.
- Predicting re-emergence times of dengue epidemics at low reproductive numbers: DENV1 in Rio de Janeiro, 1986-1990. Journal of the Royal Society Interface, 17, 20200273.
2019
- A modelling approach for correcting reporting delays in disease surveillance data. Statistics in Medicine.
- Precision epidemiology of arboviral diseases. Journal of Public Health and Emergency.
2018
- Zika: an ongoing threat to women and infant. Cadernos de Saúde Pública.
- Estimating the effective reproduction number of dengue considering temperature-dependent generation intervals. Epidemics.
- Infodengue: A nowcasting system for the surveillance of arboviruses in Brazil. Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique.
- Assessment of a trap based Aedes aegypti surveillance program using mathematical modeling. PLOS ONE.
- Estimating under-observation and the full size of the 2016 Zika epidemic in Rio de Janeiro. PLoS One, 13(10), e0205001.
2017
- The introduction of dengue follows transportation infrastructure changes in the state of Acre, Brazil: A network-based analysis. PLOS Neglected Tropical Diseases.
- Dengue prediction by the web: Tweets are a useful tool for estimating and forecasting Dengue at country and city level. PLoS Neglected Tropical Diseases, 11(7), e0005729.
2016
- Epidemiological data accessibility in Brazil. The Lancet Infectious Diseases.
- Dengueme: a tool for the modeling and simulation of dengue spatiotemporal dynamics. International Journal of Environmental Research and Public Health, 13(9), 920.
Theses and dissertations
2026
- Yasmin Toledo dos Santos. Desigualdades no acesso à confirmação laboratorial de dengue: aspectos individuais, epidemiológicos e de vigilância epidemiológica. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Cláudia Torres Codeço.
2025
- Dalila Machado Botelho Oliveira. Potencial do Epidemic Intelligence from Open Sources (EIOS) como ferramenta complementar para a detecção precoce de surtos de dengue e chikungunya: uma análise baseada em dados do Brasil. Dissertação (Mestrado em Medicina Tropical). Orientadora: Cláudia Torres Codeço. Co-orientadora: Alexandra Almeida.
- Iasmim Ferreira de Almeida. Dengue e chikungunya nos municípios brasileiros: padrões de transmissão e seus determinantes, 2010-2024. Tese (Doutorado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço. Co-orientadora: Raquel Lana.
- Jo de Napole Arruda Dias. Modelagem preditiva para dengue: integração de dados epidemiológicos, climáticos e comportamentais utilizando BART. Dissertação (Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Leonardo Soares Bastos.
- Danielle Andreza da Cruz Ferreira. Da introdução ao estabelecimento de Aedes aegypti e da dengue em uma área urbana do Sul do Brasil: padrões espaço-temporais e fatores de risco. Tese (Doutorado em Parasitologia) - Universidade Federal de Minas Gerais. Orientador: Ricardo Toshio Fujiwara, coorientadoras: Raquel Martins Lana e Laís Picinini Freitas.
2024
- Julie Souza. Extending PINNs for Parameter Estimation and Analysis of Epidemic Models in the Presence of Environmental Drivers. Tese (Doutorado em Modelagem Matemática) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.
2023
- Guilherme dos Santos. A multivariate approach for correcting reporting delays in infectious disease surveillance. Dissertação (Mestrado em Estatística) - Universidade Federal do Rio de Janeiro. Coorientador: Leonardo Soares Bastos.
- Bruna Drumond Silveira. Tipologias intraurbanas de receptividade e vulnerabilidade à dengue, chikungunya e Zika nos espaços intraurbanos brasileiros. Tese (Doutorado em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Christovam Barcellos, coorientadora: Cláudia Torres Codeço.
- Henrique Berenger. Aplicações de Transformers na previsão de séries temporais em epidemiologia. Dissertação (Modelagem Matemática da Informação) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.
2022
- Nathaly Pereira Dutra Gonçalves. Análise da distribuição dos critérios de confirmação dos casos de chikungunya em residentes do estado do Rio de Janeiro no período de 2015 a 2020. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço.
2021
- Iasmim Almeida. Caracterização dos perfis epidemiológicos de dengue nos municípios de seis estados brasileiros, 2010-2019. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço. Co-orientador: Raquel Lana.
- Valter de Assis Moreno Jr. Estimation of the SIR model parameters using neural networks. Dissertação (Modelagem Matemática da Informação) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.
2019
- Ana Carolina Arruda. Avaliação do sistema de vigilância sentinela de arboviroses no Rio de Janeiro. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço. Co-orientador: Leonardo Bastos.
- Giovanni Mizzi. Improving dengue fever surveillance with online data. PhD thesis, University of Warwick. Supervisors: Suzy Moat and Tobias Preis. Coorientador: Leonardo Soares Bastos.
2018
- Thaina Castro da Silva. Estimação do número reprodutivo da dengue a partir de dados de vigilância. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Daniel Villela. Coorientadora: Cláudia Torres Codeço.
- Marcio Maciel Bastos. Estimating the under observation and the Full Size of Zika epidemic of 2016 in Rio de Janeiro. Dissertação (Modelagem Matemática da Informação) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.
- Elisa Mussumeci. A Machine Learning approach to Dengue Forecasting: Comparing LSTM Random Forest and Lasso. Dissertação (Modelagem Matemática da Informação) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.
2017
- Cecilia Marques Toledo. Modelos de transmissão e risco de introdução e propagação de dengue em área de clima temperado. Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais. Orientador: Mauro Teixeira, coorientadora: Cláudia Torres Codeço.
- Raquel Martins Lana. Malária e Dengue: Análise da dinâmica espacial e temporal em relação às alterações ambientais, climáticas e do comportamento humano no estado do Acre, região Amazônica. Tese (Doutorado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço.
- Leon Diniz Alves. Modelagem espaço-temporal da dengue e seus determinantes climáticos. Tese (Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Flávio Codeço Coelho, coorientadora: Raquel Martins Lana.
2016
- Sara de Souza Oliveira. Desenvolvimento de um sistema de alerta para dengue usando dados de ovitrampas. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço.
- Rayane Cupolillo Ferreira. O padrão etário na dinâmica temporal da dengue no Rio de Janeiro. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Paula Luz, coorientadora: Cláudia Torres Codeço.
- Cecilia Pessanha Lima. Comparando a saúde no Brasil com os países da OCDE: minerando dados de saúde pública. Dissertação (Modelagem Matemática da Informação) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.