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Explore platforms related to the arbovirus research and surveillance ecosystem, with resources for data, modeling, forecasting, and epidemiological intelligence.

• Análise de situação epidemiológica da dengue em ano de El Niño (01/2026)
• Análise de situação epidemiológica da dengue em ano de El Niño (02/2026)
• Relatório IMDC 2025: Previsões para a temporada 2025-2026 de dengue
• Relatório IMDC 2024: Previsões para a temporada 2024-2025 de dengue
• Reflexões sobre o risco de arboviroses em 2024
• Pathfinder Infodengue: Mapeamento de processos orientado por dados para o desenvolvimento de soluções e capacidades em pesquisa. Fiocruz/TGHN LAC, 2025.

• Preparing for the 2025 dengue season: insights from predictive models (1st IMDC)

  PT EN ES
• Webinar for the official announcement of the results of the validation of the second IMDC

  EN
• Webinar with the official results and predictions for the upcoming season

  EN
• Preparing for the 2026 dengue season: insights from predictive models (2nd IMDC)

  PT EN ES

The items below follow the consolidated selection from the document used to create this page.

2025

• The Role of Climate Change in the Expansion of Dengue. medRxiv, 2025.
• Spatiotemporal relationships between extreme weather events and arbovirus transmission across Brazil. medRxiv, 2025.
• A statistical model for forecasting probabilistic epidemic bands for dengue cases in Brazil. Infectious Disease Modelling, 2025.
• Unraveling regional variability in Dengue outbreaks in Brazil: leveraging the Moving Epidemics Method (MEM) and climate data to optimize vector control strategies. PLOS Neglected Tropical Diseases, 19(6), e0013175.
• Strengthening resilience to emerging vector-borne diseases in Europe: lessons learnt from countries facing endemic transmission. The Lancet Regional Health - Europe, 53.
• Leveraging probabilistic forecasts for dengue preparedness and control: The 2024 Dengue Forecasting Sprint in Brazil. Proceedings of the National Academy of Sciences, 123(7), e2508989123.
• Large-scale epidemiological modelling: scanning for mosquito-borne diseases spatio-temporal patterns in Brazil. Royal Society Open Science, 12(5), 241261.
• Assessing mosquito dynamics and dengue transmission in Foz do Iguaçu, Brazil through an enhanced temperature-dependent mathematical model. PLoS One, 20(9), e0330902.
• Introduction, establishment, and distribution of Aedes aegypti and dengue in a temperate capital of Brazil: a retrospective surveillance-based study. The Lancet Regional Health - Americas, 48:101153.

2024

• Harmonizing multisource data to inform vector-borne disease risk management strategies. Annual Review of Entomology, 70.
• Mosqlimate: a platform to providing automatable access to data and forecasting models for arbovirus disease. arXiv preprint, 2024.
• Dengue nowcasting in Brazil by combining official surveillance data and Google Trends information. medRxiv, 2024.
• A roadmap to account for reporting delays for public health situational awareness - a case study with COVID-19 and dengue in United States jurisdictions. medRxiv, 2024.
• Beyond the Metropolises: The Spread of Chikungunya in the Interior of Brazil. SSRN, 4872336.
• Beyond the metropolises: the decentralization of chikungunya to non-metropolitan areas across Brazil. Cadernos de Saúde Pública, 42(1):e00129025.

2023

• Joint spatial modeling of the risks of co-circulating mosquito-borne diseases in Ceará, Brazil. Spatial and Spatio-temporal Epidemiology, 47, 100616.
• A Platform for Data-Centric, Continuous Epidemiological Analyses (EpiGraphHub): Descriptive Analysis. Journal of Medical Internet Research, 25, e40554.
• Epidemic models and their use. Physics of Life Reviews, 45, 29-30.
• The expansion of chikungunya in Brazil. The Lancet Regional Health - Americas, 25.

2022

• Fast expansion of dengue in Brazil. The Lancet Regional Health - Americas.
• Faster indicators of chikungunya incidence using Google searches. PLOS Computational Biology.
• How heterogeneous is the dengue transmission profile in Brazil? A study in six Brazilian states. PLoS Neglected Tropical Diseases, 16(9), e0010746.

2021

• A framework for weather-driven dengue virus transmission dynamics in different Brazilian regions. International Journal of Environmental Research and Public Health.
• Probabilistic seasonal dengue forecasting in Vietnam: A modelling study using superensembles. PLOS Medicine.
• Modelling misreported data. In Building a Platform for Data-Driven Pandemic Prediction.

2020

• Large-scale multivariate forecasting models for Dengue - LSTM versus random forest regression. Spatial and Spatio-temporal Epidemiology.
• Emerging arboviruses in the urbanized amazon rainforest. BMJ.
• Predicting re-emergence times of dengue epidemics at low reproductive numbers: DENV1 in Rio de Janeiro, 1986-1990. Journal of the Royal Society Interface, 17, 20200273.

2019

• A modelling approach for correcting reporting delays in disease surveillance data. Statistics in Medicine.
• Precision epidemiology of arboviral diseases. Journal of Public Health and Emergency.

2018

• Zika: an ongoing threat to women and infant. Cadernos de Saúde Pública.
• Estimating the effective reproduction number of dengue considering temperature-dependent generation intervals. Epidemics.
• Infodengue: A nowcasting system for the surveillance of arboviruses in Brazil. Revue d'Épidémiologie et de Santé Publique.
• Assessment of a trap based Aedes aegypti surveillance program using mathematical modeling. PLOS ONE.
• Estimating under-observation and the full size of the 2016 Zika epidemic in Rio de Janeiro. PLoS One, 13(10), e0205001.

2017

• The introduction of dengue follows transportation infrastructure changes in the state of Acre, Brazil: A network-based analysis. PLOS Neglected Tropical Diseases.
• Dengue prediction by the web: Tweets are a useful tool for estimating and forecasting Dengue at country and city level. PLoS Neglected Tropical Diseases, 11(7), e0005729.

2016

• Epidemiological data accessibility in Brazil. The Lancet Infectious Diseases.
• Dengueme: a tool for the modeling and simulation of dengue spatiotemporal dynamics. International Journal of Environmental Research and Public Health, 13(9), 920.

2026

• Yasmin Toledo dos Santos. Desigualdades no acesso à confirmação laboratorial de dengue: aspectos individuais, epidemiológicos e de vigilância epidemiológica. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Cláudia Torres Codeço.

2025

• Dalila Machado Botelho Oliveira. Potencial do Epidemic Intelligence from Open Sources (EIOS) como ferramenta complementar para a detecção precoce de surtos de dengue e chikungunya: uma análise baseada em dados do Brasil. Dissertação (Mestrado em Medicina Tropical). Orientadora: Cláudia Torres Codeço. Co-orientadora: Alexandra Almeida.
• Iasmim Ferreira de Almeida. Dengue e chikungunya nos municípios brasileiros: padrões de transmissão e seus determinantes, 2010-2024. Tese (Doutorado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço. Co-orientadora: Raquel Lana.
• Jo de Napole Arruda Dias. Modelagem preditiva para dengue: integração de dados epidemiológicos, climáticos e comportamentais utilizando BART. Dissertação (Mestrado em Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Leonardo Soares Bastos.
• Danielle Andreza da Cruz Ferreira. Da introdução ao estabelecimento de Aedes aegypti e da dengue em uma área urbana do Sul do Brasil: padrões espaço-temporais e fatores de risco. Tese (Doutorado em Parasitologia) - Universidade Federal de Minas Gerais. Orientador: Ricardo Toshio Fujiwara, coorientadoras: Raquel Martins Lana e Laís Picinini Freitas.

2024

• Julie Souza. Extending PINNs for Parameter Estimation and Analysis of Epidemic Models in the Presence of Environmental Drivers. Tese (Doutorado em Modelagem Matemática) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.

2023

• Guilherme dos Santos. A multivariate approach for correcting reporting delays in infectious disease surveillance. Dissertação (Mestrado em Estatística) - Universidade Federal do Rio de Janeiro. Coorientador: Leonardo Soares Bastos.
• Bruna Drumond Silveira. Tipologias intraurbanas de receptividade e vulnerabilidade à dengue, chikungunya e Zika nos espaços intraurbanos brasileiros. Tese (Doutorado em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Christovam Barcellos, coorientadora: Cláudia Torres Codeço.
• Henrique Berenger. Aplicações de Transformers na previsão de séries temporais em epidemiologia. Dissertação (Modelagem Matemática da Informação) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.

2022

• Nathaly Pereira Dutra Gonçalves. Análise da distribuição dos critérios de confirmação dos casos de chikungunya em residentes do estado do Rio de Janeiro no período de 2015 a 2020. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço.

2021

• Iasmim Almeida. Caracterização dos perfis epidemiológicos de dengue nos municípios de seis estados brasileiros, 2010-2019. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço. Co-orientador: Raquel Lana.
• Valter de Assis Moreno Jr. Estimation of the SIR model parameters using neural networks. Dissertação (Modelagem Matemática da Informação) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.

2019

• Ana Carolina Arruda. Avaliação do sistema de vigilância sentinela de arboviroses no Rio de Janeiro. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço. Co-orientador: Leonardo Bastos.
• Giovanni Mizzi. Improving dengue fever surveillance with online data. PhD thesis, University of Warwick. Supervisors: Suzy Moat and Tobias Preis. Coorientador: Leonardo Soares Bastos.

2018

• Thaina Castro da Silva. Estimação do número reprodutivo da dengue a partir de dados de vigilância. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Daniel Villela. Coorientadora: Cláudia Torres Codeço.
• Marcio Maciel Bastos. Estimating the under observation and the Full Size of Zika epidemic of 2016 in Rio de Janeiro. Dissertação (Modelagem Matemática da Informação) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.
• Elisa Mussumeci. A Machine Learning approach to Dengue Forecasting: Comparing LSTM Random Forest and Lasso. Dissertação (Modelagem Matemática da Informação) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.

2017

• Cecilia Marques Toledo. Modelos de transmissão e risco de introdução e propagação de dengue em área de clima temperado. Tese (Doutorado em Bioquímica e Imunologia) - Universidade Federal de Minas Gerais. Orientador: Mauro Teixeira, coorientadora: Cláudia Torres Codeço.
• Raquel Martins Lana. Malária e Dengue: Análise da dinâmica espacial e temporal em relação às alterações ambientais, climáticas e do comportamento humano no estado do Acre, região Amazônica. Tese (Doutorado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço.
• Leon Diniz Alves. Modelagem espaço-temporal da dengue e seus determinantes climáticos. Tese (Biologia Computacional e Sistemas) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientador: Flávio Codeço Coelho, coorientadora: Raquel Martins Lana.

2016

• Sara de Souza Oliveira. Desenvolvimento de um sistema de alerta para dengue usando dados de ovitrampas. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Cláudia Torres Codeço.
• Rayane Cupolillo Ferreira. O padrão etário na dinâmica temporal da dengue no Rio de Janeiro. Dissertação (Mestrado em Epidemiologia em Saúde Pública) - Fundação Oswaldo Cruz. Orientadora: Paula Luz, coorientadora: Cláudia Torres Codeço.
• Cecilia Pessanha Lima. Comparando a saúde no Brasil com os países da OCDE: minerando dados de saúde pública. Dissertação (Modelagem Matemática da Informação) - Fundação Getúlio Vargas. Orientador: Flávio Codeço Coelho.